Ligt eraan als je er meerdere websites wilt hebben met de zelfde user base dan is het wellicht handig, anders zie ik er het nut niet echt van in omdat te gaan doen.

Ik heb het ooit als voorzorgmaatregel gedaan. De ene database had alle gegevens, dan was er ook nog een database met alleen de userid en username. Deze laatste database gebruikte ik om informatie uit te halen vanuit een Java applicatie. Dit deed ik met deze tabel zodat ik zeker wist dat het wachtwoord van de gebruiker niet gehackt kon worden uit deze database, omdat dit gegeven er niet in stond.

Daarna kwam ik er achter wat je met JSON kan doen en heb ik dit nooit meer nodig gehad.

Met een MySQL-database hoef je het niet te overwegen voor de performance. Wellicht is het in jouw geval een logische functionele keuze om de boel op te splitsen, maar in andere gevallen zou ik het niet doen.

Als je beide databases op een andere machine gaat draaien, dan ga je natuurlijk wel performancewinst opleveren, maar ik denk niet dat dat in jouw geval zo is?