De borders van je tabellen heeft ook te maken met je websites css. Voor het andere zou ik het niet direct weten.

Gebruik ook ckeditor en ondervindt geen problemen bij het mee kopiëren van opmaak.
Ik gebruik het enkel echter maar in mijn back-end om content op te maken in de editor en op te slaan in de db en zo terug te tonen in de view front-end.

Ja ik kopieer ook geen word docu maar puur HTML en of CSS
Misschien is dat ook het probleem, zou eens de documentatie checken rond die word functies op de website van ckeditor. Misschien doe je het verkeerd.

Edit: Ik zie net dat pastefromword een addon is, zorg er ook voor dat deze ingeschakeld is (dus je ckeditor zelf samenstellen en de addon toevoegen) zorg ook dat je de juiste functies gebruik i.v.m. formatting enz documentatie: http://ckeditor.com/addon/pastefromword

Ik raad je ook aan indien je deze addon en bijhorende functies gebruikt om je word document zo netjes mogelijk te houden, volgens de richtlijnen van word zelf om overbodige of ongewenste content te vermijden. Ik zie online veel problemen betreffende onzichtbare content dat mee gekopieerd word omdat mensen meerdere child elementen aanmaken voor bv maar 1 lijst..

ik heb ook geen last van ckeditor. maar ik doe ook mijn html &css rechtstreeks in mijn databases. zodat het op de front end mooi overkomt